Search In this Thesis
   Search In this Thesis  
العنوان
Molecular matching among field isolates and vaccinal strains of foot and mouth disease virus in egypt /
المؤلف
Shahen, Nehal Mohamed Abd El-Fatah.
هيئة الاعداد
باحث / نهال محمد عبدالفتاح شاهين
مشرف / سعد شعراوى على شعراوى
مناقش / أيمن سعيد إمام الهباء
مناقش / نجلاء محمد عبد العزيز
الموضوع
Foot and mouth disease. Vaccine. Virus Diseases.
تاريخ النشر
2021.
عدد الصفحات
80 p. :
اللغة
الإنجليزية
الدرجة
الدكتوراه
التخصص
Veterinary (miscellaneous)
تاريخ الإجازة
01/01/2021
مكان الإجازة
جامعة بنها - كلية الطب البيطري - الفيرولوجيا
الفهرس
Only 14 pages are availabe for public view

from 96

from 96

Abstract

تستورد مصر حيوانات إنتاج اللحم من دول أخرى لسد احتياجاتها مما يزيد من فرص دخول العديد من مسببات الأمراض يتوطن فيروس الحمى القلاعية فى مصر على الرغم من الحجر الصحي والتطعيم الشامل للسيطرة على الفيروس . يتم التحصين كل ستة أشهر بلقاح يحتوى المعزولات المحلية للأنماط المصلية A و O وSAT2.يتميز فيروس مرض الحمى القلاعية بمعدلات تطفر عالية أثناء تضاعفه والتي يمكن أن تؤدي إلى استبدال النوكليوتيدات في منطقة الكابسيد وبالتالي في البروتينات الهيكلية مما يؤدي إلى وجود عترات جديدة مغايرة انتيجينياً وهذا يتطلب مراقبة مستمرة للعترات المنتشرة محليا للتأكد من أن اللقاح مناسب للغرض.في هذه الدراسة تم تجميع 45 عينة (السائل الحويصلي وانسجة ظهارة اللسان وأنسجة القلب) من حالات مشتبه في اصابتها بمرض الحمى القلاعية فى 4 محافظات مختلفة في منطقة الدلتا (القليوبية ، الشرقية ، الغربية ، البحيرة) في مصر خلال 2016 - 2019بغرض التوصيف الجزيئي لعترات الفيروس ومطابقتها مع العترات اللقاحية.أظهرت هذه الدراسة النتائج الاتية:1- أظهر الكشف عن فيروس مرض الحمى القلاعية في العينات المشتبه فيهاباستخدام اختبار البلمرة المتسلسل الناسخ العكسى حقيقى الزمن الذي يستهدف المنطقة الثابتة3D لجينوم فيروس مرض الحمى القلاعية أن 32 عينة كانت إيجابية في المحافظات الممثلة (11 من 15 عينة تم جمعها من القليوبية ، 7 من أصل 10 عينات تم جمعها من الشرقية. ، 7 من 8 عينات تم جمعها من الغربية و 7 من 12 عينة تم جمعها من محافظة البحيرة).2- أظهر عزل الفيروس على خط خلايا كلى اليربوع السورى -21 أن 26 (75.7٪) من 32 عينة أظهرت نتائج إيجابية (10 من 15 عينة جمعت من القليوبية ، 6 من أصل 10 عينات جمعت من الشرقية ، 3 من 8 عينات جمعت من محافظة الغربية و7 عينات من اصل 12 عينة تم جمعها من محافظة البحيرة ذات الخاصية) مع ظهور التـأثيرالخلوى المرضى المميز للفيروس على الخلايا.3- أظهر استخدام اختبار الانزيم المدمج المناعى (الاليزا) الكاشف عن الانتيجين لمعرفة النوع المصلى للفيروس نتائج ايجابية مع ستة وعشرين معزولة من فيروس مرض الحمى القلاعية وتم معرفة النوع المصلي لها (A و O و SAT2 ) وكان النوع المصلى SAT2 هو السائد فى 12 (46٪) معزولة ويليها النوع المصلى O والنوع المصلى Aفى7 (30٪) من المعزولات لكليهما.4- أظهر الكشف عن معزولات فيروس مرض الحمى القلاعية وتحديد نوعها المصلى باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل الناسخ العكسى أن 26 (81.2٪) من 32 عينة كانت موجبة للإختبارفيروس مرض الحمى القلاعية 7)النوع المصلي A ، 7للنوع المصلي O و 12 للنوع المصلي SAT2).5- تم تحديد التسلسل النيوكلوتيدى لمنطقةVP1لجينوم فيروس مرض الحمى القلاعية لعدد 3 عينات للنمط المصلي O و4 عينات للنمط المصلي A و5 عينات للنمط المصلي SAT2 وتم نشرها على قاعدة بيانات بنك الجينات.6- أظهرالتحليل التتابعى الجينى لمنطقة VP1لجينوم معزولات فيروس مرض الحمى القلاعية النتائج التالية:تنتمي معزولات فيروس مرض الحمى القلاعية النوع المصلي O الثلاثة في هذه الدراسة إلى النمط الجغرافىEA-3 بينما تنتمى العترة اللقاحية للفيروس من النمط المصلي O[FMDV O/EGY/MNF-2009 (JQ837833)]الى نسب Pan Asia2 من النمط الجغرافىME-SA ، وكان كان هناك اختلاف بين معزولات النمط المصلي O وسلالة اللقاح تتراوح بين 16.5-18.3٪ على مستوى النوكليوتيدات كما كشفت محاذاة الأحماض الأمينية لـ VP1 لسلالة اللقاح والسلالات الحقلية عن تغييرات في أربعة أماكن حرجة للاحماض الامينية ارقام (45 ، 48 ، 133 و 140) في العترات الحقلية لفيروس مرض الحمى القلاعية من النمط المصلي O.تنتمي معزولات فيروس مرض الحمى القلاعية النوع المصليA للعام 2017 الى تحت نسب Iran05BAR08 sublineage وإلى النمط الجغرافى Asian لفيروس مرض الحمى القلاعية من النمط المصليA، وفى الجانب أخرى تنتمي معزولات فيروس مرض الحمى القلاعية النوع المصليA 2018 إلى النمط الجغرافىAfrican G-IV. كما يوجد اختلافات بين معزولات لفيروس مرض الحمى القلاعية النوع المصليAللعام 2018 وسلالة اللقاح تتراوح بين 26.1-24.2٪ على مستوى النيوكليوتيدات. وكان هناك تباين بين معزولات فيروس مرض الحمى القلاعية النوع المصليAللعام 2017وسلالة اللقاح تتراوح من 5.8-4.9٪ على مستوى النيوكليوتيدات. كما كشفت محاذاة الأحماض الأمينية لـ VP1 لسلالة اللقاح والسلالات الحقلية عن تغييرات في اثنين من الاماكن حرجة للاحماض الامينية ارقام(141 و 149) في معزولات فيروس مرض الحمى القلاعية النوع المصليAللعام 2018. بينما لا توجد تغييرات في الموقعين السابقين بين العترات اللقاحية والمعزولات الحقلية فيروس مرض الحمى القلاعية النوع المصليAللعام 2017.تنتمي معزولات فيروس مرض الحمى القلاعية النوع المصليSAT2 الخمسة في هذه الدراسة إلى النمط الجغرافى topotype VIIحيث انتمت معزولتانSAT2- 2016 وSAT2- 2017الى نسب Alx-12 lineage ، كما انتمت الثلاث معزولات المتبقية SAT2- 2017 وSAT2- 2018و SAT2- 2018 الى نسب Lib-12 lineage من النمط الجغرافىtopotype VI I. كما أظهرت معزولات فيروس مرض الحمى القلاعية النوع المصليSAT2للدراسة الحالية تطابق بنسبة 83.9-88.5٪ مع سلالة اللقاح التي تنتمي إلى النسبGhb-12 من النمط الجغرافىtopotype VII . كما كشفت محاذاة الأحماض الأمينية لـ VP1 لسلالة اللقاح والسلالات الحقلية عن تغييرات في عدة أماكن حرجة للاحماض الامينية ارقام(137 ، 138 ، 139 ، 140 ، 156 ، 157 ، 200 ، 201 ، 202) في المعزولات الحقلية لفيروس مرض الحمى القلاعية النوع المصليSAT2 أخيرًا ، تبين أن الأنماط المصلية A و O و SAT2لفيروس مرض الحمى القلاعية كانت جميعها منتشرة في مصر خلال 2016-2019 وكان النمط المصلي SAT2 هو النمط المصلي السائد المنتشر في الحقل يليه الأنماط المصليةO و A. وكانت الأنماط المصلية A و O و SAT2 من السلالات الحقلية لفيروس مرض الحمى القلاعية مختلفة عن تلك الخاصة بالعترات اللقاحية ويمكن ارجاع ذلك إلى التحور المستمر لفيروس مرض الحمى القلاعية وانتقال عترات جديدة عبر الحدود.تبرز التغيرات الملحوظة في الأحماض الأمينية في المطابقة بين العترات الحقلية واللقاحية للانواع المصلية لفيروس مرض الحمى القلاعية ضرورة إجراء مزيد من البحوث من خلال الطرق السيرولوجية والمراقبة المستمرة للعترت المنتشرة وذلك لتحديث العترات اللقاحية وضمان الحماية الفعالة للحيوانات المعرضة للإصابة.